“運輸成本太高。”有業內人士表示，秸稈運輸也是難題。由于秸稈質量輕、體積大，導致運輸車輛經常超寬超高，運輸一趟“驚險”萬分，經常被公路收費站罰兩次錢，另外針對秸稈運輸也沒開辟“綠色通道”，過橋、過路費是一塊不小的費用。
另據了解，濟南也出現過秸稈造蜂窩煤、秸稈制作家具等，但因成本太高、市場不認可等原因，.終都逐漸消失了。“2006年濟南涌現出不少秸稈綜合利用的企業，但能夠進一步推廣普及的幾乎沒有。”提到原因，濟南市農業局人士直言，秸稈的綜合利用只靠企業的努力遠遠不夠，還得靠科研機構的技術攻堅和政府的支持。
據介紹，目前機械化秸稈還田已不存在技術障礙，但推廣起來面臨成本難題。比如，秸稈還田需要收割機加載粉碎裝置，而這需要三四千元的購置成本，此外，收割機作業時，耗油等成本更高，這讓農民的積極性普遍不高。省科學院能源研究所副所長張曉東介紹，很多農民反映用秸稈燃氣燒水做飯時火總是不太旺，獲知這一情況后，能源研究所的工作人員檢查發現，秸稈氣化后產生的燃氣熱值比較低，“燒水還可以，如果用來炒菜，火顯得就不太旺”。因為燃氣中氮含量非常高，這就使得燃氣的熱值很低。