1、機械化秸稈還田。秸稈還田的方法有兩種：一是用機械將秸稈打碎，耕作時深翻嚴埋，利用土壤中的微生物將秸稈腐化分解。另一種秸稈回田的有效方法是將秸稈粉碎后，摻進適量石灰和人畜糞便，讓其發酵，在半氧化半還原的環境里變質腐爛，再取出肥田使用。
2、 過腹還田。過腹還田是將秸稈通過青貯、微貯、氨化、熱噴等技術處理，可有效改變秸稈的組織結構，使秸稈成為易于家畜消化、口感性好的優質飼料。
3、 培育食用菌。將秸稈粉碎后，與其他配料科學配比作食用菌栽培基料，可培育木耳、蘑菇、銀耳等食用菌，能有效地解決近幾年食用菌生產迅猛發展與棉籽殼供應不足的矛盾。育菌后的基料經處理后，仍可作為家畜飼料或作肥料還田。
4、制取沼氣。稻草秸稈等屬于有機物質，是制取沼氣的好材料。我國的北方、南方都能利用，尤其是南方地區，氣溫高，利用沼氣的季節長。制取沼氣可采用厭氧發酵的方法。此方法是將種植業、養殖業和沼氣池有機結合起來，利用秸稈產生的沼氣進行做飯和照明，沼渣喂豬，豬糞和沼液作為肥料還田。
此種方式是生態農業良性循環的良好模式，它適應了現代化農村發展的需求，受到農民群眾的熱烈歡迎。
5、 用作工業原料。農作物秸稈