同時，該市鼓勵農民經紀人和農機專業合作社廣泛參與，實現秸稈借腹還田，種養緊密結合，有效解決焚燒秸稈污染環境難題的同時，還增加了農民收入。傳統的奶牛養殖區域飼草需求大量增加，玉米全株青貯和黃貯面積相應增大。提前引進打捆機、小麥收割機、玉米青貯機等大型現代化農機裝備，對園區周邊5000多畝小麥秸稈進行打捆收集，用于奶牛飼料，并與當地30多家農民合作社簽訂了種植面積達5萬畝的全株青貯玉米協議書，增加了農民收入。
這些試點縣市，要將80%的農資綜合補貼存量資金，加上種糧農民直接補貼和農作物良種補貼資金合并，政策目標則調整為“耕地地力保護”。補貼對象為所有擁有耕地承包權的種地農民。享受補貼的農民要做到耕地不撂荒，地力不降低。兩部委要求，補貼資金要與耕地面積或播種面積掛鉤，并嚴格掌握補貼政策界限。對已作為畜牧養殖場使用的耕地、林地、成片糧田轉為設施農業用地、非農業征(占)用耕地等已改變用途的耕地，以及長年拋荒地、占補平衡中“補”的面積和質量達不到耕種條件的耕地等不再給予補貼。用于耕地地力保護的補貼資金直接現金補貼到戶。
根據《意見》，其支持的糧食適度規模經營，既可以是以土地有序流轉形成的土地適度規模經營，也可以是土地股份合作和聯合或土地托管方式、龍頭企業與農民或合作社簽訂訂單實現規模經營的方式、農業社會化服務組織提供專業的生產服務實現區域規模經營等其他形式的糧食適度規模經營。
不過，對于農業補貼向新型經營主體傾斜，也有一些專家學者提出質疑，認為會損害小農利益。中國社科院農村發展研究所研究員李國祥告訴財新記者，大量補貼落入企
業口袋，假合作社套取補貼的情況也非常普遍。他認為，補貼對象仍應瞄準以家庭為單位的農戶，并應繼續完善專門針對低收入小農戶的保障機制。