“民以食為天”這句話形象地概括了人與農業與土壤的關系，即農業是人類生存的基礎，土壤是農業的根本。因此，土壤的健康狀況直接決定著農作物的產量比例，也影響著農業種植者的根本利益。
但目前，過度依賴化肥對土壤的不利影響越來越嚴重。據相關報道，全球約百分之三十三的土地因土壤鹽堿化、板結、酸化，以及化肥過量使用造成的各種化學污染，已出現中度至高度退化。在我國，土壤污染問題已經到了刻不容緩的程度， 在此背景下，國家將土壤污染防治工作納入農業領域。不得不說的是，國家“十二五”規劃中提到的“有機肥還田”。“施用有機肥可以改善土壤團粒結構，增強土壤通透性和保水保肥能力，使土壤疏松肥沃，緩解土壤鹽漬化，促進作物根系發育，提高它具有抗病抗災的能力。
眾所周知，畜禽糞便有機質含量較高，尤其是雞糞，是農家肥中常用的一種，是一種比較的有機肥。按理說，利用畜禽糞便“有機肥還田”，對土地污染防治是一件非常有利的事情，但大家卻忽略了一件事：沒有處理掉，或者是簡直就是堆積了一段時間。如果用于直接還田，短期或長期都會造成很大的危害。
短期內，由于畜禽糞便發酵不徹底和分解良好，氮以尿酸鹽的形式存在，難以被作物直接吸收。燒根、燒苗，甚至直接燒種子的現象，影響出苗率。同時，糞便中攜帶的雜菌（大腸桿菌等）、蟲卵、幼蟲等也會引起土壤病蟲害，大大提高了土壤病蟲害的發生率。 從長遠來看，如果長期使用未發酵的糞便停止還田，問題會更加嚴重。一方面，由于有害菌的優勢，腐爛和霉菌的生長，會導致種植作物的根部和葉面病害的發生，比發酵肥料高出百分之五十左右。另一方面，惡劣的生存環境也會導致土壤中的蚯蚓和各種有益生物急劇減少，從而導致肥力喪失，加劇土壤板結。
更為嚴重地是，畜禽糞便中的重金屬即使堆肥發酵也難以去除。畜禽糞便作為有機肥還田，會導致重金屬直接進入食物鏈，增加對人體健康的危害。