1.柱塞泵的活塞和泵體之間存在縫隙，柱塞泵通過活塞擠壓，讓高速流量藥液通過/入小孔徑通路時，所產生的剪切力Shear force可能會對剪切力敏感的某些生物產品產生潛在影響。2.如果產品粘度較高，柱塞泵在活塞擠壓藥液時，容易產生內腔較大的壓力，在微量灌裝時這種壓力容易影響灌裝精度，而蠕動泵相比而言，灌裝壓力相對較低。3.有些產品對金屬部件存在反應，那么無金屬部件的一次包材所構成的灌裝套件也避免了藥液與金屬的接觸。
蠕動泵泵頭有兩個滾軸組，每組有多根滾軸roller；兩根軟管tube分別經過一組滾軸，構成一個通道channel；然后兩個通道以Y形交匯在一起，兩個通道的擠壓脈沖疊加起來進行互相抵消。之后，通過精準控制的電機，將“無”脈沖的藥液加注至西林瓶，市場上，針對1ml以上灌裝量，一些品牌的蠕動泵已經可以達到+/-0.5%的灌裝精度，而且配合罐裝機的在線稱重反饋系統，可以保證灌裝的穩定性，在灌裝精度方面與柱塞泵并沒有明顯區別。
一般而言，在處理廢水時，泵必須克服三個具體的挑戰，而所有這些都可以通過安裝和使用蠕動（軟管）泵得到解決：污染的工藝用水，無論是要將其送出工廠還是予以回收以供進一步使用，都必須進行清潔。通常，清潔過程包含使用磨蝕性、腐蝕性或有毒化學品。這些化學物質中包括許多種酸。如果這些酸性物質不相容，就會損害泵的濕潤部件。在這種情況下，唯一可以使用的是所有與清洗液接觸的部件都不會輕易受到磨料或腐蝕性化學品傷害的泵技術。